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Esta acontece quando os medicamentos perdem a eficácia contra os microrganismos que deveriam combater. A situação resulta, em grande parte, do mau uso dos fármacos, em particular, os antibióticos. Se, por exemplo, não tomar as doses recomendadas ou interromper o tratamento, contribui para que a bactéria conheça o inimigo e aprenda a defender-se. Para a OMS, este problema não é novo, mas está a tornar-se cada vez mais perigoso, ameaçando a eficácia de alguns tratamentos.

A globalização do comércio e das viagens agrava o problema: os microrganismos resistentes podem espalhar-se de forma rápida pelo mundo. Por isso, aquela organização defende maior comprometimento dos governos a controlar do uso de antibióticos, para não perdemos a guerra contra as infeções.